Contact

  • LIPN, CNRS UMR 7030
    Université Sorbonne Paris Nord
    99 avenue Jean-Baptiste Clément
    93430 Villetaneuse
IUT / Enseignement Labo / Rechreche
  • guillaume.santini AT univ-paris13.fr
  • +33 (0)1 49 40 31 34
  • Bureau T110, IUT de Villetaneuse
  • guillaume.santini AT lipn.univ-paris13.fr
  • +33 (0)1 49 40 28 26
  • Bureau B306, Institut Galilée

    Recherches

Je suis maître de conférence depuis 2010 au Département Informatique de l'IUT de Villetaneuse.
Je suis membre de l’équipe A3 (Apprentissage Artificiel et Applications)
du Laboratoire d’informatique de Paris Nord (LIPN).
Mes thématiques de recherche portent sur l'extraction de connaissances dans les graphes et réseaux.

    Encadrements

Période Description
2017-20 _ _ Co-Encadrement de Thèse de Mme Stella Zevio
"Découverte et enrichissement de connaissances à partir de textes pour la recherche d’experts"
Co-encadrement avec T. Charnois et H. Zargayouna de l'équipe RCLN.
Programme FUI-22 Projet PCU (Plateforme de connaissances unifiées)

    Logiciels

J'ai participé a divers degrés au développement de plusieurs logiciels:

Nom Description
MinerLC Mining closed pattern in attributed networks (développé par Dominique Bouthinon)
ProjClos Closure Operators and Local Knowledge Discovery in Attributed Networks
LG_Clust Clustering de strutures tridimensionnelles de protéines à partir de similarité d'alignements structuraux.
Smol C. Pakleza, G.P.H. Santini et J.A.H. Cognet, (Méthodologie et logiciel de modélisation moléculaire des chaines de macromolécules (ADN, ARN, ...) : la méthodologie est appellée BCE (Biopolymer Chain Elasticity) ; Le logiciel est denommé S-mol). «2002». - Dépôt en 2002 auprès de la DRITT Université Pierre et Marie Curie - Paris VI - -

    Responsabilités

Période Description Responsabilités liées
2022- Directeur des études de la 2ème année de BUT SD (FI & FA) Membre élu du conseil de département Science des données.
2019-2020 Président de l'assemblée des chefs de département (PACD) de la spécialité STID
2019/12/02-2020/12/18
...
2020-2022 Chef de département DUT STID à l'IUT de Villetaneuse. ...
2019-2020 Responsable de la formation de DUT STID à l'IUT de Villetaneuse. Membre du conseil de département informatique
2017-2019 Co-porteur du projet d'ouverture d'un DUT STID (STatistique et Informatique décisionnelle) l'IUT de Villetaneuse .
2017-_ _ _ _ Membre de la commission Informatique du LIPN
2015-2019 Membre de la commision Web du LIPN comme responsable pour l'équipe A3
2018-2019 Directeur des études des semestres 3 et 4 du DUT Informatique de l'IUT de Villetaneuse Membre du conseil de département informatique
2014-2017 Directeur des études du semestre 1 du DUT Informatique de l'IUT de Villetaneuse Membre du conseil de département informatique
2014-2015 Membre élu au conseil d'institut de l'IUT de Villetaneuse
2011-2015 Responsable des séminaires de l'équipe A3 du LIPN

    Comités d'organisation

J'ai participé aux comités d'organisation des évennements suivants:

Évennement Description
JFGG'2013 4ième journées Fouille de Grands Graphes. Saint-Étienne - France, 16-18 octobre 2013.
JFGG'2012 3ième journées EGC Fouille de Grands Graphes. Villetaneuse - France, 17-19 octobre 2012.
MARAMI 2012 3ième conférence sur les Modèls et Analyse de Réseaux: Approches Mathématiques et Informatiques. Villetaneuse - France, 17-19 octobre 2012.
IMS'06 International Mathematica Symposium sont les congrès internationaux des utilisateurs du langage de calcul formel Mathematica. Avignon - France, 19 - 23 Juin 2006.

    Enseignements

J'enseigne en


Formation Module Nom Cours TD TP Polys
Parcours ingénieur 3ème année (FI & FA) Patrons de conception site dédié
BUT SD (FI, FA & Passerelle) R403 Classification automatique
BUT SD (FI R101 Accueil (programmation)
BUT SD (FI) R104 & R202 Introduction à la programmation
BUT SD (FI) S102 SAÉ: Lecture et écriture de fichiers
DUT SD (FI & FA) S403 Programmation haut niveau
BUT Info (Formation Continue) R203 Qualité de développement site dédié

J'ai enseigné par le passé en

Formation Module Nom Cours TD TP Polys
Licence Pro MICDTL (Formation Initiale & Apprentissage) RN3 Programmation Java et programmation objet site dédié
DUT Info (FI) M3105 Conception et programmation objet avancées site dédié
DUT Info (Formation Continue) M1103 Structures de données et algorithmes fondamentaux
DUT STID (Formation Initiale) M1301 Bases de la programmation site dédié
DUT Info (Formation Apprentissage) M1102 Introduction à l'algorithmique et à la programmation site dédié
DUT Info (FI) M2104 Bases de la conception orientée objet
DUT Info (FI) M2103 Bases de la programmation orientée objet
DUT Info (FC-AS) M1105 Conception de documents et d’interfaces numériques
DUT Info (FI) M1104 Introduction aux bases de données
DUT Info (App) M1101 Introduction aux systèmes informatiques site dédié

    Publications

Books chapters

[1] Formal Concept Analysis of Attributed Networks
Henry Soldano and Guillaume Santini and Dominique Bouthinon
apar, Springer, Lecture Notes in Social Network, Formal Concept Analysis of Social Networks, Rokia Missaoui and Sergei Obiedkov and Sergei Kuznetsov, 2017

Edition of collective works

[1] Actes de la troisième journée de fouille de grands graphes (JFGG'12), Villeteneuse, France
20 pages, Rushed Kanawati and Guillaume Santini, 2012

Selective Journals

[10] Closed-loop cycles of experiment design, execution, and learning accelerate systems biology model development in yeast
Anthony Coutant, Katherine Roper, Daniel Trejo-Banos, Dominique Bouthinon, Martin Carpenter, Jacek Grzebyta, Guillaume Santini, Henry Soldano, Mohamed Elati, Jan Ramon, Celine Rouveirol, Larisa N. Soldatova, and Ross D. King
116 (36) 18142-18147, PNAS (Proceedings of the National Academy of Sciences), 2019
[9] Bi-pattern mining of attributed networks
Soldano, Henry and Santini, Guillaume and Bouthinon, Dominique and Bary, Sophie and Lazega, Emmanuel
1, 37--, 4, Applied Network Science, 2019
[8] MinerLSD: efficient mining of local patterns on attributed networks
Atzmueller, Martin and Soldano, Henry and Santini, Guillaume and Bouthinon, Dominique
1, 43--, 4, Applied Network Science, 2019
[7] Hybrid method inference for the construction of cooperative regulatory network in human
Ines Chebil and Rémi Nicolle and Guillaume Santini and Céline Rouveirol and Mohamed Elati
2, 97--103, 13, IEEE Transactions on NanoBioscience, 2014
[6] Automatic classification of protein structures relying on similarities between alignments
Santini, Guillaume and Soldano, Henry and Pothier, Joël
1, 16 , Identification of protein structural cores requires isolation of sets of proteins all sharing a same subset of structural motifs. In the context of an ever growing number of available 3D protein structures, standard and automatic clustering algorithms require adaptations so as to allow for efficient identification of such sets of proteins., 1--13, 13, 10.1186/1471-2105-13-233, http://dx.doi.org/10.1186/1471-2105-13-233, BMC Bioinformatics, 2012
[5] Nucleic acid folding determined by mesoscale modeling and NMR spectroscopy: solution structure of d(GCGAAAGC)
Santini, Guillaume P H and Cognet, Jean A H and Xu, Duanxiang and Singarapu, Kiran K and Hervé du Penhoat, Catherine
19, ant, 6881-93, 113, The Journal of Physical Chemistry B, 2009
[4] Dinucleotide TpT and its 2'-O-Me analogue possess different backbone conformations and flexibilities but similar stacked geometries
Santini, Guillaume P H and Pakleza, Christophe and Auffinger, Pascal and Moriou, Céline and Favre, Alain and Clivio, Pascale and Cognet, Jean A H
31, ant, 9400-9, 111, The Journal of Physical Chemistry B, 2007
[3] Spectroscopic and structural impact of a stem base-pair change in \DNA hairpins: GTTC-ACA-GAAC versus GTAC-ACA-GTAC
Michèle Lamoureux and Louis Patard and Belen Hernandez and Thierry Couesnon and Guillaume P.H. Santini and Jean A.H. Cognet and Catherine Gouyette and Christine Cordier
1, 84 - 94, 65, http://dx.doi.org/10.1016/j.saa.2005.09.032, Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 2006
[2] DNA tri- and tetra-loops and RNA tetra-loops hairpins fold as elastic biopolymer chains in agreement with PDB coordinates
Santini, Guillaume and Pakleza, Christophe and Cognet Jean
31, 1086-1096, Oxford University Press, 3, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC149216/, Nucleic Acids Res., February 2003
[1] VIRTLAB: a virtual molecular biology laboratory
Iazetti, G. and Santini, Guillaume and Rau, M. and Bucci, E. and Calogero, RA
14, 815-816, 9, http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/14/9/815, Bioinformatics, 1998

Other Journals

[11] Motifs abstraits et sous-communautés dans les réseaux attribués
Henry Soldano and Guillaume Santini and Dominique Bouthinon
4, 441-468, 29, Formal Concept Analysis - 13th International Conference, ICFCA 2015, Nerja, Spain, June 23-26, 2015, Proceedings, DBLP:conf/icfca/2015, Revue d'Intelligence Artificielle, 2016

International Conferences with published proceedings

[17] Exploring and mining attributed sequences of interactions
Tiphaine Viard and Henry Soldano and Guillaume Santini
In: Complex Networks & Their Applications XI. COMPLEX NETWORKS 2022. Studies in Computational Intelligence, vol 1078, Springer2022
[16] Experiments on F-Restricted Bi-pattern Mining
Guillaume Santini and Henry Soldano and Stella Zevio
In: Benito R.M., Cherifi C., Cherifi H., Moro E., Rocha L.M., Sales-Pardo M. (eds) Complex Networks & Their Applications X. COMPLEX NETWORKS 2021. Studies in Computational Intelligence, vol 1015, Springer2021
[15] Restricted Bi-pattern Mining of Attributed Networks
Guillaume Santini and Henry Soldano and Stella Zevio
ICCS 2021. Lecture Notes in Computer Science, vol 12879. Springer, 2021
[14] A Combination of Semantic Annotation and Graph Mining for Expert Finding in Scholarly Data
Stella Zevio and Guillaume Santini and Henry Soldano and Haïfa Zargayouna and Thierry Charnois
Proceedings of the Graph Embedding and Mining (GEM) Workshop at ECML PKDD, 2020.
[13] Attributed Graph Pattern Set Selection Under a Distance Constraint.
Henry Soldano and Guillaume P.H. Santini and Dominique Bouthinon
228-241, COMPLEX NETWORKS 2019.
[12] Core Stratification of Two-Mode Networks
Henry Soldano and Sophie Bary and Guillaume P.H. Santini and Dominique Bouthinon
Volume 1 Proceedings The 7th International Conference on Complex Networks and Their Applications COMPLEX NETWORKS 2018.
[11] Hub-Authority Cores and Attributed Directed Network Mining
Henry Soldano and Guillaume Santini and Dominique Bouthinon and Emmanuel Lazega
apar, IEEE Computer Society, IEEE 29th International Conference on Tools with Artificial Intelligence (ICTAI 2017), Boston, MA, USA, 2017
[10] Local knowledge discovery in attributed graphs
Henry Soldano and Guillaume Santini and Dominique Bouthinon
250--257, IEEE Computer Society, 27th IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence (ICTAI 2015), Vietri sul Mare, Italy, Anna Esposito, 2015
[9] Abstract and Local Rule Learning in Attributed Networks
Henry Soldano and Guillaume Santini and Dominique Bouthinon
313--323, Springer, Lecture Notes in Computer Science, 9384, Lyon, France, 22nd International Symposium on Foundations of Intelligent Systems (ISMIS 2015), Lyon, France, Floriana Esposito and Mohand-Sa\"\id Hacid and Olivier Pivert and Zbigniew Ras, 2015
[8] Graph abstraction for closed pattern mining in attributed network
Soldano Henry and Santini Guillaume
849--854, IOS Press, Frontiers in Artificial Intelligence and Applications, 263, European Conference in Artificial Intelligence (ECAI), Torsten Schaub and Gerhard Friedrich and Barry O'Sullivan, 2014
[7] Graph abstraction for closed pattern mining in attributed network
Henry Soldano and Guillaume Santini
849--854, IOS Press, Frontiers in Artificial Intelligence and Applications, 263, 21st European Conference on Artificial Intelligence (ECAI 2014), Prague, Czech Republic, Torsten Schaub and Gerhard Friedrich and Barry O'Sullivan, 2014
[6] SetNet: Ensemble Method Techniques for Learning Regulatory Networks
Chebil Inès and Elati Mohamed and Rouveirol Céline and Santini Guillaume
34--39, 12th International Conference on Machine Learning and Applications, ICMLA 2013, Miami, FL, USA, December 4-7, 2013, Volume 1, DBLP:conf/icmla/2013-1, 10.1109/ICMLA.2013.14, 2013
[5] Hybrid method inference for the construction of cooperative regulatory network in human
Chebil Inès and Nicolle Rémy and Santini Guillaume and Rouveirol Céline and Elati Mohamed
121--126, 2013 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine, Shanghai, China, December 18-21, 2013, DBLP:conf/bibm/2013, 10.1109/BIBM.2013.6732474, 2013
[4] Self-organizing Trees for visualizing protein dataset
Nhat-Quang Doan and Hanane Azzag and Mustapha Lebbah and Guillaume Santini
1-8, IEEE, Dallas, US, Proceedings of the International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN 2013), 2013
[3] Self-organizing trees for visualizing protein dataset
Nhat-Quang Doan and Hanane Azzag and Mustapha Lebbah and Guillaume Santini
8 pages, 2013 International Joint Conference on Neural Networks (IJCNN 2013), Dallas, Texas, USA, 10.1109/IJCNN.2013.6707001, 2013
[2] Hybrid method inference for the construction of cooperative regulatory network in human
Ines Chebil and Rémy Nicolle and Guillaume Santini and Céline Rouveirol and Mohamed Elati
121--126, 2013 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2013), Shanghai, China, 10.1109/BIBM.2013.6732474, 2013
[1] Use of ternary similarities in graph based clustering for protein structural family classification
Santini, Guillaume and Soldano, Henry and Pothier, Joël
ant, 457--459, ACM Press, BCB '10, New York, NY, USA, Proceedings of the First ACM International Conference on Bioinformatics and Computational Biology (2010), 10.1145/1854776.1854856, 978-1-4503-0438-2, 2010

Workshops and other conferences with reviewing process

[4] Efficient Pattern Mining in Attributed Graphs
Henry Soldano and Guillaume Santini and Dominique Bouthinon
1-12, Modèles et Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatiques (MARAMI 2016), Cergy-Pontoise, France, Guy Melançon, 2016
[3] Local rules associated to k-communities in an attributed graph
Henry Soldano and Guillaume Santini and Dominique Bouthinon
1340--1347, ACM Press, Paris, MANEM\symbol64ASONAM 15, First International workshop on Multiplex and Attributed Network Mining, Paris, France, 2015
[2] Abstract and Local Concepts in Attributed Networks
Henry Soldano and Guillaume Santini and Dominique Bouthinon
CEUR-WS.org, CEUR Workshop Proceedings, 1534, Workshop on Social Network Analysis SNAFCA in conjunction with the 13th International Conference on Formal Concept Analysis (ICFCA 2015), Nerja, Spain, 2015
[1] Graph abstraction for closed pattern mining in attributed networks
Henry Soldano and Guillaume Santini
Conférence d'Apprentissage (CAP 2014), Saint-Etienne, France, Marc Sebban and Ludovic Denoyer, 2014