Les grands instruments (Clusters, Grilles, Cloud) dans le quotidien du scientifique du XXIème siècle

Suite à la rénovation de son cluster de calcul, l'université de Paris 13 à mis en place depuis deux ans plusieurs formations, à destination des chercheurs et à destination des doctorants, pour utiliser cette plateforme. Cela a été l'occasion de rassembler des compétences en formation sur les outils et les méthodes (calcul numérique) et de s'ouvrir largement à ce qui est maintenant possible de faire, dans son quotidien, avec un grand instrument. On entend par grand instrument un cluster, une grille ou un cloud. Il ne s'agit pas d'étudier les méthodes numériques ou autre aspect pointu en liaison avec un cluster, mais d'apporter des éléments de réflexion pour que le scientifique puisse, selon son processus métier, intégrer l'usage des grands instruments dans son quotidien.

Dans cette formation, nous défendons la méthode scientifique expérimentale (modélisation, analyse, passage devant la machine (grand instrument), retours sur les résultats expérimentaux) et plus particulièrement tout ce qui est en liaison avec le «passage sur le grand instrument ». Cela peut considérer le point « Comment soumettre un travail ?» mais aussi tous les points d'ordre généraux relevant de l'expérience en elle même : capacité à reproduire une expérience, description de l'expérience pour permettre sa reproductibilité, quels sont les contenus (environnements, binaires, scripts, configurations) à conserver et à diffuser ? Nous souhaitons accompagner le mouvement actuel qui va vers une augmentation de la qualité expérimentale, via la diffusion des processus expérimentaux.

Il s'agit donc d'offrir une culture générale d'accès aux grands instruments en s'ouvrant aux usages des Clusters, Grilles et Clouds. La formation est professionnalisante dans le sens où les personnes passeront, de manière systématique, devant ces grands instruments et elles le feront avec une certaine méthodologie. La formation est ancrée dans le concret avec une incise toute particulière dans l'utilisation et la pratique. Le public visé est donc tout scientifique, indépendamment de sa discipline, qui souhaite acquérir une culture de base pour utiliser les grands instruments informatiques. Cette formation pourra se compléter ultérieurement par des formations plus pointues telles qu'elles sont délivrées dans les grands centres de calcul nationaux comme l'Idris. Notre formation se veut être au plus prêt des utilisateurs de la communauté USPC.

Modalités pratiques : les personnes sont priées de s'inscrire à partir du site http://monintranet.univ-paris13.fr/formulaires/module_calcul_scientifique/. Il convient de venir aux sessions avec un portable équipé d'un client ssh (du genre putty sur windows) : une simple connexion Wifi est nécessaire. Les personnes qui s'inscrivent s'engagent à suivre l'intégralité des sessions. Les sessions donnent lieu à des travaux pratiques.

Publics visés : étudiants en doctorat ainsi que les chercheurs des différents laboratoires scientifiques de USPC.

Au terme de la formation, la personne saura utiliser :

• une machine sous Linux, au moyen des outils en ligne de commande afin d'exécuter des commandes de base ;
• les outils de connexion à distance pour lancer des travaux sur un Cluster (le cluster Magi de Paris 13 sera utilisé comme démonstrateur), récupérer des résultats ;
• une Grille (la grille d'Ile de France (GRIF) sera utilisée à cet effet) ;
• un Cloud pour déployer à la demande des services (éventuellement de calcul). Pour cela le Cloud de Paris 13 sera utilisé comme démonstrateur.

En résumé, au terme de la formation, la personne se sera approprié les différents usages de ces grands instruments, et pour chacun d'eux, les usages spécifiques que l'on peut en faire. Par exemple, pour le grand instrument Cluster, la personne fera désormais la distinction entre les usages des GPU (Graphical Processor Unit) et les usages du patron de programmation MapReduce pour traiter des grands volumes de données.

Pré-requis (en termes de compétences, expériences préliminaires, motivation) : la personne désirant suivre cette formation aura une expérience d'utilisation d'un ordinateur de bureau (PC, Mac), notamment l'utilisation d'un navigateur. Cependant nous introduisons toutes les notions de base liées au système d'exploitation (Linux) et nécessaires (connexions distantes, commandes de base de Linux, notions de base de Linux). La personne devra être motivée pour suivre un cours général d'informatique qui touche aux aspects Système (ensemble complexe d'éléments de même nature ou de même fonction) et architecturaux des grands instruments.